El Programa de Doctorado no plantea ningún requerimiento docente adicional en el periodo de investigación, salvo en aquellos casos de alumnos provenientes de másteres distintos al de Nanociencia y Nanotecnología Molecular y para los que la Comisión Académica Mixta considere que debe cursar determinadas asignaturas de dicho master como complemento a su formación. El número de créditos a cursar en este caso nunca podrá superar los 60 créditos.

Los alumnos del Máster en Nanociencia y Nanotecnología Molecular deberán  cursar los 60 créditos restantes para finalizarlo.

Durante el periodo de investigación el estudiante se centrará en realizar el trabajo de investigación que constituirá su Tesis Doctoral. Las tesis doctorales estarán dirigidas por personal docente e investigador que tenga acreditado al menos un sexenio de investigación, salvo en los casos en los que la situación contractual del director no le haya permitido presentarse a la solicitud de sexenios, en cuyo caso deberá acreditar un curriculum investigador equivalente.